RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 FDX1P10109 184 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PTPRAP18433 802 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 SLC16A2P36021 539 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CUL5Q93034 780 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 C12orf42Q96LP6 360 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CLIC4Q9Y696 253 aa14.74□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 TOMM70O94826 608 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 BACE1P56817 501 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 MAP3K9P80192 1104 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PTPAQ15257 358 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 TTC38Q5R3I4 469 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 FBXO11Q86XK2 927 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CSADQ9Y600 493 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 OTOFQ9HC10 1997 aa14.73□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 UNCXA6NJT0 531 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 ADM5C9JUS6 153 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CUTAO60888 179 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 APLP1P51693 650 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 MAP3K11Q16584 847 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 CDCA5Q96FF9 252 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PGBD1Q96JS3 809 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.72□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 LAD1O00515 517 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 AP3B2Q13367 1082 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 MTMR2Q13614 643 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 GSE1Q14687 1217 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 FERMT2Q96AC1 680 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 COA7Q96BR5 231 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.71□□□□□ -0.05
NISCH-203ENST00000460759 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 CMA1P23946 247 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 ZNF445P59923 1031 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 SPP2Q13103 211 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.7□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 ABCB11O95342 1321 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 MYPNQ86TC9 1320 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 POTECB2RU33 542 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 VCAM1P19320 739 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 PTPREP23469 700 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 VGLL4Q14135 290 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 NEK8Q86SG6 692 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 FSIP1Q8NA03 581 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 KIFC2Q96AC6 838 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 RRAGCQ9HB90 399 aa14.69□□□□□ -0.06
NISCH-203ENST00000460759 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms