RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 ACLYP53396 1101 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 PDE1AP54750 535 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 CNTN2Q02246 1040 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 GNASQ5JWF2 1037 aa10.13□□□□□ -0.79
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SH3BP1-204ENST00000459646 GPR153Q6NV75 609 aa10.13□□□□□ -0.79
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SH3BP1-204ENST00000459646 DNAH12Q6ZR08 3092 aa10.09□□□□□ -0.79
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SH3BP1-204ENST00000459646 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
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SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM47Q9BQJ4 181 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 ANAPC4Q9UJX5 808 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 PLIN4Q96Q06 1357 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 COL6A3P12111 3177 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF536O15090 1300 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 MROH7Q68CQ1 1323 aa10.08□□□□□ -0.8
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