RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54-208ENST00000458278 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54-208ENST00000458278 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54-208ENST00000458278 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54-208ENST00000458278 PTH1RQ03431 593 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 H0YGN5 161 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ICAM1P05362 532 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 COL6A1P12109 1028 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 TRDNQ13061 729 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 PNMA1Q8ND90 353 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 KAT14Q9H8E8 782 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 RNF146Q9NTX7 359 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 PNMA2Q9UL42 364 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 PFASO15067 1338 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ALPK3Q96L96 1907 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 EVI5O60447 810 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ALAS1P13196 640 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 SLC16A2P36021 539 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC174Q6PII3 467 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 MAP4K1Q92918 833 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 TNKSO95271 1327 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 DNM1LO00429 736 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 CYP21A2P08686 494 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 SNAP25P60880 206 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 MCM3APO60318 1980 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 POTEB2H3BUK9 544 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 FGD4Q96M96 766 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-208ENST00000458278 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 E7EWF7 191 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 RARBP10826 455 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 AKR1A1P14550 325 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 SEC23AQ15436 765 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 NCOA7Q8NI08 942 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 KBTBD13C9JR72 458 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 CNTN2Q02246 1040 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ASB14A6NK59 587 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ANO1Q5XXA6 986 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ARMCX2Q7L311 632 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ERICH2A1L162 156 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 NEFLP07196 543 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 ACVR2BQ13705 512 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 LRRC41Q15345 812 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 NSMFQ6X4W1 530 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 MAF1Q9H063 256 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 LCTP09848 1927 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 RNF180Q86T96 592 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-208ENST00000458278 SKAP1Q86WV1 359 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms