RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, human

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRA-208	ENST00000455631	NDUFB10	O96000	172 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	FGD4	Q96M96	766 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631		F5H6K3	240 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	ZBED4	O75132	1171 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	PLA2G5	P39877	138 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	KLRC3	Q07444	240 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	MYH4	Q9Y623	1939 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	CD4	P01730	458 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	FGB	P02675	491 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	KIFC2	Q96AC6	838 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	HIPK3	Q9H422	1215 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	CCER2	I3L3R5	266 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	BEX3	Q00994	111 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	UBE3C	Q15386	1083 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	NYAP2	Q9P242	653 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	FBXO40	Q9UH90	709 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRA-208	ENST00000455631	CTAGE5	O15320	804 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM122A	Q96E09	287 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	RASA1	P20936	1047 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	PANK1	Q8TE04	598 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	HAUS7	Q99871	368 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	ATP5J	P18859	108 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	RABGGTB	P53611	331 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	CCL23	P55773	120 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	CHST13	Q8NET6	341 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	KATNBL1	Q9H079	304 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	TNFAIP2	Q03169	654 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	NCOR1	O75376	2440 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	ASTN1	O14525	1302 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	NKX3-2	P78367	333 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	CNTN2	Q02246	1040 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	ITGA7	Q13683	1181 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	TLK2	Q86UE8	772 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	FEM1B	Q9UK73	627 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	HMMR	O75330	724 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	CABYR	O75952	493 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	OAZ1	P54368	228 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PTPRA-208	ENST00000455631	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	MYOG	P15173	224 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	TFF2	Q03403	129 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	ZBBX	A8MT70	800 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	B4GALT4	O60513	344 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	SBK1	Q52WX2	424 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	ACAD9	Q9H845	621 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	BMP1	P13497	986 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	AAK1	Q2M2I8	961 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	GRIN2D	O15399	1336 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	ZEB2	O60315	1214 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	PTGS1	P23219	599 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	CEP95	Q96GE4	821 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	KCNQ1	P51787	676 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	PSMC6	P62333	389 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PTPRA-208	ENST00000455631	SCLY	Q96I15	445 aa		27.72	■■■□□ 2.03

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