RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 RNF146Q9NTX7 359 aa24.75■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 PFASO15067 1338 aa24.75■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 RARBP10826 455 aa24.74■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 CCDC174Q6PII3 467 aa24.74■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.74■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 KDM4AO75164 1064 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 ALAS1P13196 640 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 AKR1A1P14550 325 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.73■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 ZNF536O15090 1300 aa24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 SLC34A2O95436 690 aa24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 ICAM1P05362 532 aa24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 PDHBP11177 359 aa24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 CHMLP26374 656 aa24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 KAT14Q9H8E8 782 aa24.72■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 B4E1Z4 1266 aa24.71■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 POTEB2H3BUK9 544 aa24.71■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 TRDNQ13061 729 aa24.71■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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LTB-211ENST00000446745 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.71■■□□□ 1.55
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LTB-211ENST00000446745 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.71■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.71■■□□□ 1.55
LTB-211ENST00000446745 SLC16A2P36021 539 aa24.7■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 ZNF543Q08ER8 600 aa24.7■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 RNF180Q86T96 592 aa24.7■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.7■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 PNMA1Q8ND90 353 aa24.69■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.69■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.68■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 SNHG28P0DPA3 235 aa24.68■■□□□ 1.54
LTB-211ENST00000446745 SNAP25P60880 206 aa24.68■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.67■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 A0A1W2PPC1 479 aa24.66■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.66■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.65■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.65■■□□□ 1.54
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LTB-211ENST00000446745 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 FGD4Q96M96 766 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 PHF24Q9UPV7 400 aa24.63■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.62■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 ERICH2A1L162 156 aa24.62■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.62■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 SYN1P17600 705 aa24.62■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 PTH1RQ03431 593 aa24.62■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
LTB-211ENST00000446745 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.62■■□□□ 1.53
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