RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 METTL13Q8N6R0 699 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PIK3C2GO75747 1445 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 LAD1O00515 517 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 GNGT2O14610 69 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CFBP00751 764 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PDE6AP16499 860 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PTK2Q05397 1052 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MTX1Q13505 466 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RAPH1Q70E73 1250 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 STK32BQ9NY57 414 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 GNPATO15228 680 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 VAMP4O75379 141 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SNCBQ16143 134 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 NIM1KQ8IY84 436 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 USH1GQ495M9 461 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TEX12Q9BXU0 123 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 STK17AQ9UEE5 414 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KCNJ18B7U540 433 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 HSPA6P17066 643 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KCNJ12Q14500 433 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TRIM15Q9C019 465 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SCINQ9Y6U3 715 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SSH2Q76I76 1423 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TMEM247A6NEH6 219 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 XAGE2Q96GT9 111 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MMS19Q96T76 1030 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MYO10Q9HD67 2058 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MORC3Q14149 939 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 DYMQ7RTS9 669 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 GPBP1Q86WP2 473 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CPXCR1Q8N123 301 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 FBXO41Q8TF61 875 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PANK4Q9NVE7 773 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 POLKQ9UBT6 870 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ATP8B3O60423 1300 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TAF11Q15544 211 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PDXDC1Q6P996 788 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RETREG2Q8NC44 543 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RNF14Q9UBS8 474 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PLXNC1O60486 1568 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TFDP1Q14186 410 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 DLGAP5Q15398 846 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 IP6K1Q92551 441 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ARMT1Q9H993 441 aa7.28□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MYO1FO00160 1098 aa7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PFDN1O60925 122 aa7.27□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ATP2B4P23634 1241 aa7.27□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms