RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF174Q15697 407 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 DGKHQ86XP1 1220 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 RETREG2Q8NC44 543 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 DESI2Q9BSY9 194 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 HAUS4Q9H6D7 363 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 SASH3O75995 380 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 OAS2P29728 719 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 NLRP5P59047 1200 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 STIM1Q13586 685 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 MTF1Q14872 753 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 MASTLQ96GX5 879 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 NUP58Q9BVL2 599 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.05■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CTAGE15A4D2H0 777 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 FAM205CA6NFA0 338 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 KCNJ18B7U540 433 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 H0YIN7 160 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CTAGE8P0CG41 777 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 KCNJ12Q14500 433 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 WDR93Q6P2C0 686 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CTAGE6Q86UF2 777 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CTAGE4Q8IX94 777 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 NELFBQ8WX92 580 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ABCF2Q9UG63 623 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 LGALS16A8MUM7 142 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ARHGAP25P42331 645 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 STX17P56962 302 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 GPR162Q16538 588 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 BLIDQ8IZY5 108 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ADSSL1Q8N142 457 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 AK8Q96MA6 479 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 DNAJC7Q99615 494 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 LTBP1Q14766 1721 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 PSMD14O00487 310 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CDK17Q00537 523 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 AMPD2Q01433 879 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 ST7Q9NRC1 585 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 L1RE1Q9UN81 338 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL1-203ENST00000439248 USP17L12C9JPN9 530 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 USP17L21D6R901 530 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 BBOX1O75936 387 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 RHOBTB3O94955 611 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 ALDH1B1P30837 517 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 DNM2P50570 870 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 KRT83P78385 493 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 FIGNQ5HY92 759 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 CERS3Q8IU89 383 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 SLC35F6Q8N357 371 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 RUBCNQ92622 972 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL1-203ENST00000439248 M0R2N6 131 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms