RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDK7P50613 346 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 GJA9P57773 515 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM240Q5SV17 173 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARMCX2Q7L311 632 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 OSBP2Q969R2 916 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 FGD4Q96M96 766 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARVCFO00192 962 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 MIER1Q8N108 512 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM199Q8N511 208 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHST13Q8NET6 341 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 APPBP2Q92624 585 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CEP95Q96GE4 821 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.85■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 PBX2P40425 430 aa21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 PBX4Q9BYU1 374 aa21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 GPAA1O43292 621 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTLL1O95922 423 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 APPP05067 770 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ACRP10323 421 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 OAZ1P54368 228 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CNTN2Q02246 1040 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF365Q70YC5 407 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPM1EQ8WY54 764 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 MKL1Q969V6 931 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.83■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 BDP1A6H8Y1 2624 aa21.82■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.82■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 BEX3Q00994 111 aa21.82■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.82■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 GPATCH3Q96I76 525 aa21.82■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.82■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.82■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 BMP3P12645 472 aa21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 GNAT2P19087 354 aa21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 CYP2C18P33260 490 aa21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 RASIP1Q5U651 963 aa21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLFN13Q68D06 897 aa21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 KATNBL1Q9H079 304 aa21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 ACAD9Q9H845 621 aa21.81■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM232C9JQI7 657 aa21.8■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 M0R2C6 588 aa21.8■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 CTAGE5O15320 804 aa21.8■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNFAIP2Q03169 654 aa21.8■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.8■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSPY3P0CV98 308 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSPY8P0CW00 308 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 FDX1P10109 184 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 STAT2P52630 851 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 IL23AQ9NPF7 189 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 RNF146Q9NTX7 359 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 MSRAQ9UJ68 235 aa21.79■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD4P01730 458 aa21.78■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 TLK2Q86UE8 772 aa21.78■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.78■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.78■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 HIPK3Q9H422 1215 aa21.78■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 ASTN1O14525 1302 aa21.78■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 ASB14A6NK59 587 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNFRSF10AO00220 468 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 NKX3-2P78367 333 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDE4BQ07343 736 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 RAB30Q15771 203 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM160B2Q86V87 743 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 HERVK_113Q902F9 699 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.77■■□□□ 1.08
UPK3BP1-201ENST00000428678 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms