RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBX21Q9UL17 535 aa15.71■□□□□ 0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.71■□□□□ 0.11
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R2C6 588 aa15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCY6O43306 1168 aa15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OAZ1P54368 228 aa15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST13Q8NET6 341 aa15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.71■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELP1O95163 1332 aa15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL1O95922 423 aa15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMP1P01033 207 aa15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASGR1P07306 291 aa15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMCX2Q7L311 632 aa15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPC25Q9HBM1 224 aa15.7■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APPP05067 770 aa15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP3P12645 472 aa15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJB2P25686 324 aa15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJA9P57773 515 aa15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCTPP1Q9H773 170 aa15.69■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPY3P0CV98 308 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPY8P0CW00 308 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK7P50613 346 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLFN13Q68D06 897 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD5Q6N075 450 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KATNBL1Q9H079 304 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACAD9Q9H845 621 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.68■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARVCFO00192 962 aa15.67■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FDX1P10109 184 aa15.67■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE4BQ07343 736 aa15.67■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIN2CQ14957 1233 aa15.67■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.67■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM232C9JQI7 657 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAT2P52630 851 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTN2Q02246 1040 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNASQ5JWF2 1037 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC174Q6PII3 467 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIFAQ96CG3 184 aa15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTAGE5O15320 804 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKX3-2P78367 333 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM240Q5SV17 173 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM160B2Q86V87 743 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAPBQ9H115 298 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF576Q9H609 170 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF146Q9NTX7 359 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF536O15090 1300 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSF2RAP15509 400 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC1A4P43007 532 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFAP4Q01664 338 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPARAQ07869 468 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASIP1Q5U651 963 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM199Q8N511 208 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GMCL1Q96IK5 515 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.65■□□□□ 0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCTP09848 1927 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASTN1O14525 1302 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB14A6NK59 587 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEX3Q00994 111 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFAIP2Q03169 654 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TKFCQ3LXA3 575 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP38Q8NB14 1042 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHURC1Q8WUH1 139 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSD1Q9BTV5 496 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PBX4Q9BYU1 374 aa15.64■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC3AQ02505 3323 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms