RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.62■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM58Q8NG06 486 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.62■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 TTLL1O95922 423 aa23.61■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 RASGRF1Q13972 1273 aa23.61■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAM9Q13443 819 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 CSRNP1Q96S65 589 aa23.61■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6BA6NDN3 693 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 DAPK3O43293 454 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.6■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LARGE1O95461 756 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 GAS8O95995 478 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV5-2P06315 115 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 BRINP3Q76B58 766 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.6■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 RASA3Q14644 834 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 NR5A1Q13285 461 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LIFRP42702 1097 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD1Q719H9 257 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-201ENST00000418331 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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PTPRJ-201ENST00000418331 FAM170AA1A519 330 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-201ENST00000418331 HLFQ16534 295 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL13Q8N6R0 699 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-201ENST00000418331 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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