RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 DCTPP1Q9H773 170 aa22.99■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 MTMR7Q9Y216 660 aa22.99■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 ASGR1P07306 291 aa22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 TFAP4Q01664 338 aa22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 MKL1Q969V6 931 aa22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 TOX2Q96NM4 488 aa22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.98■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 EYSQ5T1H1 3165 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 ADCY6O43306 1168 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 CNTN2Q02246 1040 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 GNASQ5JWF2 1037 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 ACAD9Q9H845 621 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 ERC2O15083 957 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 TIMP1P01033 207 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 SLC1A4P43007 532 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 STAT2P52630 851 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 OAZ1P54368 228 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 PPARAQ07869 468 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC174Q6PII3 467 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 FGD4Q96M96 766 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 RNF146Q9NTX7 359 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 STX8Q9UNK0 236 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN4-202ENST00000415164 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 ALAS1P13196 640 aa22.95■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 MCCP23508 829 aa22.95■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJB2P25686 324 aa22.95■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 SNAP25P60880 206 aa22.95■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 BEX3Q00994 111 aa22.95■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.95■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.263e-8■□□□□ 9.3
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UBXN4-202ENST00000415164 ELP1O95163 1332 aa22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TSPY2A6NKD2 308 aa22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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UBXN4-202ENST00000415164 KCTD1Q719H9 257 aa22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TBX21Q9UL17 535 aa22.94■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.93■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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UBXN4-202ENST00000415164 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.93■■□□□ 1.26
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UBXN4-202ENST00000415164 FAM160B2Q86V87 743 aa22.93■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.93■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.93■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.92■■□□□ 1.26
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UBXN4-202ENST00000415164 CSF2RAP15509 400 aa22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TNFAIP2Q03169 654 aa22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 GRIN2CQ14957 1233 aa22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM199Q8N511 208 aa22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TIFAQ96CG3 184 aa22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 CDH23Q9H251 3354 aa22.92■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 FDX1P10109 184 aa22.91■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC96Q2M329 555 aa22.91■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
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UBXN4-202ENST00000415164 INCENPQ9NQS7 918 aa22.91■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 ASB14A6NK59 587 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 NMT2O60551 498 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 CDK7P50613 346 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 NSMFQ6X4W1 530 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TLK2Q86UE8 772 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 PPM1EQ8WY54 764 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 GMCL1Q96IK5 515 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF576Q9H609 170 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 TOMM22Q9NS69 142 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF536O15090 1300 aa22.89■■□□□ 1.26
UBXN4-202ENST00000415164 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.89■■□□□ 1.25
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