RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 CYP27A1Q02318 531 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 DDR1Q08345 913 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 AP3B2Q13367 1082 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 ZNF521Q96K83 1311 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 LTBP1Q14766 1721 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 RASSF10A6NK89 507 aa8.49□□□□□ -1.05
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CCL20-202ENST00000409189 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 NBPF4Q96M43 638 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.49□□□□□ -1.05
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CCL20-202ENST00000409189 ASPAP45381 313 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 MTHFSP49914 203 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 SOX10P56693 466 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 RAD18Q9NS91 495 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 A0A0C4DFX4 3053 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 TMPRSS2O15393 492 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 ITGB5P18084 799 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 HOXC9P31274 260 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 FAAP100Q0VG06 881 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 DEFB115Q30KQ5 88 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 COG3Q96JB2 828 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 RUNDC1Q96C34 613 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 RTL1A6NKG5 1358 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 GRM2Q14416 872 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 PDE3AQ14432 1141 aa8.45□□□□□ -1.06
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CCL20-202ENST00000409189 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 KDRP35968 1356 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 LDHDQ86WU2 507 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 FLCNQ8NFG4 579 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CSRNP1Q96S65 589 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 KRT82Q9NSB4 513 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 SZT2Q5T011 3432 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 E9PSI1 815 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 ZNF862O60290 1169 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 RFC4P35249 363 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 CAPNS2Q96L46 248 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 FLT4P35916 1363 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 APAF1O14727 1248 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 RPS6KA4O75676 772 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CCL20-202ENST00000409189 LIG1P18858 919 aa8.42□□□□□ -1.06
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