RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 DYDC2Q96IM9 177 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 RNF8O76064 485 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 MUM1L1Q5H9M0 696 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PGBD1Q96JS3 809 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.74□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 MFAP3LO75121 409 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PPP6R2O75170 966 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 HLA-DOAP06340 250 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 SEPT2Q15019 361 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PRR16Q569H4 304 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 NUGGCQ68CJ6 796 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PALM2Q8IXS6 379 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 MAIP1Q8WWC4 291 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 GSDMAQ96QA5 445 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 WDR24Q96S15 920 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 MMEP08473 750 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 VSNL1P62760 191 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 BIRC3Q13489 604 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ZMYM6O95789 1325 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PASKQ96RG2 1323 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 GMNCA6NCL1 334 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 TCP11X2Q5H9J9 407 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 TAF5LO75529 589 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 GSTO1P78417 241 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PHEXP78562 749 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 OTUD6AQ7L8S5 288 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 SLC39A2Q9NP94 309 aa10.73□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ATF2P15336 505 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PSMD2Q13200 908 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 TBK1Q9UHD2 729 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 SATB1Q01826 763 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 CCDC89Q8N998 374 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 CYTH2Q99418 400 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ABCC2Q92887 1545 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 A2MP01023 1474 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 BCRP11274 1271 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 FLT4P35916 1363 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 WDR44Q5JSH3 913 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 NEK9Q8TD19 979 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 HAUS2Q9NVX0 235 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 RASGRF2O14827 1237 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ZAP70P43403 619 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 GUCY1A3Q02108 690 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PICALMQ13492 652 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 RIC8AQ9NPQ8 531 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 RNF14Q9UBS8 474 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 RASSF10A6NK89 507 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 C6orf229H3BNL8 230 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 GNA14O95837 355 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 CORO7P57737 925 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 PPP4R1Q8TF05 950 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 COG1Q8WTW3 980 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 AP1M1Q9BXS5 423 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 EXOC3O60645 756 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 CYP21A2P08686 494 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 TMED2Q15363 201 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 CALCRLQ16602 461 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 CASC4Q6P4E1 433 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF25Q86VW2 580 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 MSANTD4Q8NCY6 345 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms