RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395436.6

SUMF2-204, Transcript of sulfatase modifying factor 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMF2, Length 1,683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF2-204ENST00000395436 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.51■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 TRAPPC10P48553 1259 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMF2-204ENST00000395436 PGBD1Q96JS3 809 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMF2-204ENST00000395436 AMNQ9BXJ7 453 aa23.51■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.51■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.5■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 ADCY7P51828 1080 aa23.49■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 CSADQ9Y600 493 aa23.49■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.48■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 POTEJP0CG39 1038 aa23.47■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 ADALQ6DHV7 355 aa23.47■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 PARP14Q460N5 1801 aa23.46■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.46■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.46■■□□□ 1.35
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SUMF2-204ENST00000395436 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 A0A1W2PQ27 194 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 A0A1W2PQ64 194 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 A0A1W2PQD8 194 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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SUMF2-204ENST00000395436 LDHDQ86WU2 507 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.43■■□□□ 1.34
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SUMF2-204ENST00000395436 PPATQ06203 517 aa23.42■■□□□ 1.34
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SUMF2-204ENST00000395436 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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SUMF2-204ENST00000395436 CCDC174Q6PII3 467 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 ELP3Q9H9T3 547 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 TMEM260Q9NX78 707 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 RLFQ13129 1914 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 CUTAO60888 179 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMF2-204ENST00000395436 FDX1P10109 184 aa23.41■■□□□ 1.34
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