RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 KAT14Q9H8E8 782 aa36.09■■■■□ 3.37
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CMTM4-202ENST00000394106 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CMTM4-202ENST00000394106 TNKSO95271 1327 aa36.08■■■■□ 3.37
CMTM4-202ENST00000394106 FRMPD3Q5JV73 1810 aa36.08■■■■□ 3.37
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF543Q08ER8 600 aa36.08■■■■□ 3.37
CMTM4-202ENST00000394106 TRDNQ13061 729 aa36.08■■■■□ 3.37
CMTM4-202ENST00000394106 BTNL9Q6UXG8 535 aa36.08■■■■□ 3.37
CMTM4-202ENST00000394106 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa36.08■■■■□ 3.37
CMTM4-202ENST00000394106 NECAB2Q7Z6G3 386 aa36.08■■■■□ 3.37
CMTM4-202ENST00000394106 PNMA1Q8ND90 353 aa36.08■■■■□ 3.37
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CMTM4-202ENST00000394106 RNF146Q9NTX7 359 aa36.07■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 SNHG28P0DPA3 235 aa36.06■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 ANKS1AQ92625 1134 aa36.06■■■■□ 3.36
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CMTM4-202ENST00000394106 TINF2Q9BSI4 451 aa36.06■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa36.06■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 MSCO60682 206 aa36.05■■■■□ 3.36
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CMTM4-202ENST00000394106 TKFCQ3LXA3 575 aa36.05■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 CYB5R4Q7L1T6 521 aa36.05■■■■□ 3.36
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CMTM4-202ENST00000394106 CCPG1Q9ULG6 757 aa36.05■■■■□ 3.36
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CMTM4-202ENST00000394106 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa36.04■■■■□ 3.36
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CMTM4-202ENST00000394106 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 C11orf49Q9H6J7 331 aa36.03■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 E7EWF7 191 aa36.02■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 ICAM1P05362 532 aa36.02■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 ANO1Q5XXA6 986 aa36.02■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 SEPT4O43236 478 aa36.01■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
CMTM4-202ENST00000394106 MUM1L1Q5H9M0 696 aa36■■■■□ 3.35
CMTM4-202ENST00000394106 NCOA7Q8NI08 942 aa36■■■■□ 3.35
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CMTM4-202ENST00000394106 STOX1Q6ZVD7 989 aa35.99■■■■□ 3.35
CMTM4-202ENST00000394106 UBA5Q9GZZ9 404 aa35.99■■■■□ 3.35
CMTM4-202ENST00000394106 CPVLQ9H3G5 476 aa35.99■■■■□ 3.35
CMTM4-202ENST00000394106 NRBP1Q9UHY1 535 aa35.99■■■■□ 3.35
CMTM4-202ENST00000394106 CNPY2Q9Y2B0 182 aa35.99■■■■□ 3.35
CMTM4-202ENST00000394106 SEC23AQ15436 765 aa35.98■■■■□ 3.35
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CMTM4-202ENST00000394106 SMCHD1A6NHR9 2005 aa35.97■■■■□ 3.35
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CMTM4-202ENST00000394106 FGD4Q96M96 766 aa35.96■■■■□ 3.35
CMTM4-202ENST00000394106 PFASO15067 1338 aa35.96■■■■□ 3.35
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CMTM4-202ENST00000394106 ERICH2A1L162 156 aa35.94■■■■□ 3.34
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CMTM4-202ENST00000394106 FAM133AQ8N9E0 248 aa35.94■■■■□ 3.34
CMTM4-202ENST00000394106 NR2E3Q9Y5X4 410 aa35.94■■■■□ 3.34
CMTM4-202ENST00000394106 CDC45O75419 566 aa35.93■■■■□ 3.34
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CMTM4-202ENST00000394106 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
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CMTM4-202ENST00000394106 COL6A1P12109 1028 aa35.92■■■■□ 3.34
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CMTM4-202ENST00000394106 ARRDC4Q8NCT1 418 aa35.92■■■■□ 3.34
CMTM4-202ENST00000394106 PNMA2Q9UL42 364 aa35.92■■■■□ 3.34
CMTM4-202ENST00000394106 DNM1LO00429 736 aa35.91■■■■□ 3.34
CMTM4-202ENST00000394106 SLC27A2O14975 620 aa35.91■■■■□ 3.34
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CMTM4-202ENST00000394106 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa35.91■■■■□ 3.34
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CMTM4-202ENST00000394106 WDR19Q8NEZ3 1342 aa35.9■■■■□ 3.34
CMTM4-202ENST00000394106 SOWAHBA6NEL2 793 aa35.9■■■■□ 3.34
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CMTM4-202ENST00000394106 AKR1A1P14550 325 aa35.9■■■■□ 3.34
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CMTM4-202ENST00000394106 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CMTM4-202ENST00000394106 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CMTM4-202ENST00000394106 SENP2Q9HC62 589 aa35.9■■■■□ 3.34
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