RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ZBED4O75132 1171 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 TTLL1O95922 423 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 APPP05067 770 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 GNAT2P19087 354 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CDK7P50613 346 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 PPARAQ07869 468 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 VPS53Q5VIR6 699 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ARMCX2Q7L311 632 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 MYLIPQ8WY64 445 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 DDX11Q96FC9 970 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 FEM1BQ9UK73 627 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 FAM184BQ9ULE4 1060 aa15.84■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM232C9JQI7 657 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 BMP3P12645 472 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TFAP4Q01664 338 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TOX2Q96NM4 488 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 MUC3AQ02505 3323 aa15.83■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 LCTP09848 1927 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 ASGR1P07306 291 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 RAG1P15918 1043 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 OAZ1P54368 228 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 GJA9P57773 515 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 ANKRD35Q8N283 1001 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 CHST13Q8NET6 341 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 GPATCH3Q96I76 525 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TSPY3P0CV98 308 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TSPY8P0CW00 308 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 MCCP23508 829 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 BEX3Q00994 111 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 FPGSQ05932 587 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 KCTD1Q719H9 257 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 GMCL1Q96IK5 515 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 FSD1Q9BTV5 496 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 GRIN2DO15399 1336 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TIMP1P01033 207 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 NOVP48745 357 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 NKX3-2P78367 333 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 GRIN2CQ14957 1233 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 USP38Q8NB14 1042 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 NAPBQ9H115 298 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 RNF146Q9NTX7 359 aa15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 ELP1O95163 1332 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 MX1P20591 662 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 STAT2P52630 851 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 PDE4BQ07343 736 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM240Q5SV17 173 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 RASIP1Q5U651 963 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 VWCEQ96DN2 955 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 ACAD9Q9H845 621 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 FBXO40Q9UH90 709 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 ARVCFO00192 962 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 CD4P01730 458 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 ACRP10323 421 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 CSF2RAP15509 400 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 SMPD1P17405 629 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 PBX2P40425 430 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 GNASQ5JWF2 1037 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 MFSD5Q6N075 450 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC174Q6PII3 467 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.78■□□□□ 0.12
CNGA3-202ENST00000393503 REV3LO60673 3130 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.5 ms