RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 SERPINB2P05120 415 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SYCE1Q8N0S2 351 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PLA2G4DQ86XP0 818 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM204AQ9H8W3 233 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PREX2Q70Z35 1606 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 RESTQ13127 1097 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCB5Q2M3G0 1257 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM102BQ5T8I3 360 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 IQCDQ96DY2 449 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PGBD1Q96JS3 809 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 BCS1LQ9Y276 419 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 MMP1P03956 469 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SLFN12Q8IYM2 578 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 DYNLL2Q96FJ2 89 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 HGSO14964 777 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC8A3P57103 927 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SYNE4Q8N205 404 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 HINFPQ9BQA5 517 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 HAUS4Q9H6D7 363 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC16A2P36021 539 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 MCAMP43121 646 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SETDB1Q15047 1291 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 XKR9Q5GH70 373 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAPPC10P48553 1259 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 E7EVH7 732 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNK3O14649 394 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFAIP1Q13829 316 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF1BO60333 1816 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 KCTD1Q719H9 257 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CLRN2A0PK11 232 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 RASA3Q14644 834 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGEF16Q5VV41 709 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 AMNQ9BXJ7 453 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 AMFRQ9UKV5 643 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 GBP6Q6ZN66 633 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 DEPTORQ8TB45 409 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 IWS1Q96ST2 819 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM37O94972 964 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 GUCY2FP51841 1108 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC17Q96LX7 622 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC3O15438 1527 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SLFN14P0C7P3 912 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 LONRF2Q1L5Z9 754 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CNKSR1Q969H4 720 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SERPINB13Q9UIV8 391 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 NOD1Q9Y239 953 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 LIFRP42702 1097 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT71Q3SY84 523 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 MCTP2Q6DN12 878 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 TBCKQ8TEA7 893 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PIGSQ96S52 555 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 K7ENM7 598 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 UBXN2AP68543 259 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC41Q15345 812 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 COA7Q96BR5 231 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM7Q9C029 511 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 GNPTABQ3T906 1256 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF34Q969K3 372 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 CSRNP1Q96S65 589 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP5DP30049 168 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 IKBKBO14920 756 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 TAF12Q16514 161 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 HYOU1Q9Y4L1 999 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP10DQ9P241 1426 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-202ENST00000392011 NDC80O14777 642 aa18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms