RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC12A7Q9Y666 1083 aa17.94■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 KLRF2D3W0D1 207 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ICAM1P05362 532 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2B6P20813 491 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 UBXN2AP68543 259 aa17.93■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 USP6NLQ92738 828 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 MMP19Q99542 508 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 APBA2Q99767 749 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 UBA5Q9GZZ9 404 aa17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa17.93■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 SGMS1Q86VZ5 419 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX11Q96FC9 970 aa17.92■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 SENP2Q9HC62 589 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CCPG1Q9ULG6 757 aa17.92■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa17.91■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRF4Q8IZF3 695 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC2Q9BYS8 371 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TM6SF1Q9BZW5 370 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ACAD9Q9H845 621 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 MAD2L2Q9UI95 211 aa17.91■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF536O15090 1300 aa17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 HMGCRP04035 888 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ELNP15502 786 aa17.9■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF333Q96JL9 665 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TRERF1Q96PN7 1200 aa17.9■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF146Q9NTX7 359 aa17.9■□□□□ 0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD14CQ5VZR4 134 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RUFY3Q7L099 469 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 STAG2Q8N3U4 1231 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 TCEANC2Q96MN5 208 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.89■□□□□ 0.45
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PGGT1B-202ENST00000379615 RCAN1P53805 252 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2R5BQ15173 497 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL16Q8N461 479 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FANCBQ8NB91 859 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CPVLQ9H3G5 476 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 JMJD4Q9H9V9 463 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PFASO15067 1338 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB43O43298 467 aa17.87■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 COBLO75128 1261 aa17.87■□□□□ 0.45
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PGGT1B-202ENST00000379615 APOA5Q6Q788 366 aa17.87■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZUG5 572 aa17.87■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO11Q86XK2 927 aa17.87■□□□□ 0.45
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PGGT1B-202ENST00000379615 MYL10Q9BUA6 226 aa17.87■□□□□ 0.45
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PGGT1B-202ENST00000379615 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.87■□□□□ 0.45
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB5O15062 677 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 CPA1P15085 419 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 QRICH1Q2TAL8 776 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 C8orf34Q49A92 452 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 MICU3Q86XE3 530 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 BRF1Q92994 677 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SPZ1Q9BXG8 430 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 AMNQ9BXJ7 453 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
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