RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371786.3

C9orf116-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf116, Length 612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-201ENST00000371786 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 FSTL1Q12841 308 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 COG2Q14746 738 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 NPY5RQ15761 445 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 SPRYD7Q5W111 196 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 FBXO11Q86XK2 927 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 AMNQ9BXJ7 453 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 PARP14Q460N5 1801 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 KIF28PB7ZC32 967 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 FDX1P10109 184 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 CALML3P27482 149 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 DSG3P32926 999 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 GTF2A2P52657 109 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 GALNT17Q6IS24 598 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 MYPNQ86TC9 1320 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 RLFQ13129 1914 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ESYT2A0FGR8 921 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 SMCO2A6NFE2 343 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 BTBD18B2RXH4 712 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ZBED4O75132 1171 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 KRT2P35908 639 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 TRAF1Q13077 416 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 CCDC174Q6PII3 467 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 OXER1Q8TDS5 423 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 VWA5AO00534 786 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 CETPP11597 493 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 RGMBQ6NW40 437 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 BRAPQ7Z569 592 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 BLIDQ8IZY5 108 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ATG4CQ96DT6 458 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 C6orf50Q9HD87 102 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ICAM1P05362 532 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 GNA11P29992 359 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 USH1GQ495M9 461 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF536O15090 1300 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf116-201ENST00000371786 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ADAMTS3O15072 1205 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 NR5A1Q13285 461 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 REPS2Q8NFH8 660 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 TNFRSF25Q93038 417 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 M0R2N6 131 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 OSBPP22059 807 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ADCY7P51828 1080 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 CCL15Q16663 113 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 BICD2Q8TD16 824 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 PNMA2Q9UL42 364 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 ABCB11O95342 1321 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 OAZ1P54368 228 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 CPXCR1Q8N123 301 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 CUL5Q93034 780 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 GBP4Q96PP9 640 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf116-201ENST00000371786 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms