RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CPVLQ9H3G5 476 aa26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 STXBP3O00186 592 aa26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 TXLNAP40222 546 aa26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 RAD9BQ6WBX8 426 aa26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 BARHL2Q9NY43 387 aa26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.94■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC25AP30304 524 aa26.93■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.93■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.93■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 GAKO14976 1311 aa26.93■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 MFAP3LO75121 409 aa26.93■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.93■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC51Q96ER9 411 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 LZTFL1Q9NQ48 299 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 KLRF2D3W0D1 207 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF5CO60282 957 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 PLCG2P16885 1265 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CNGA4Q8IV77 575 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 ITIH6Q6UXX5 1313 aa26.91■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC151A5D8V7 595 aa26.91■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 C6orf229H3BNL8 230 aa26.91■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBB2AQ13885 445 aa26.91■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 INF2Q27J81 1249 aa26.91■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.91■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.91■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 FECHP22830 423 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CHMP4BP1P59074 171 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 FUT8Q9BYC5 575 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 FOCADQ5VW36 1801 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 BRD3Q15059 726 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CPLX3Q8WVH0 158 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP95Q96GE4 821 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.9■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 OAS2P29728 719 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 GALNT17Q6IS24 598 aa26.89■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP112Q8N8E3 955 aa26.89■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.89■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC23Q9UJX2 597 aa26.89■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.89■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM37O94972 964 aa26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 CASP14P31944 242 aa26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2IP78347 998 aa26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 COBLO75128 1261 aa26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPA1LP34931 641 aa26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBB4BP68371 445 aa26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 SLF2Q8IX21 1173 aa26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.88■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 PP2D1A8MPX8 630 aa26.87■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 GYPCP04921 128 aa26.87■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.87■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 POTEB2H3BUK9 544 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 LONRF2Q1L5Z9 754 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 RIMBP2O15034 1052 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 NOVP48745 357 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 SP8Q8IXZ3 490 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 PROM2Q8N271 834 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 DISC1Q9NRI5 854 aa26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 STAT6P42226 847 aa26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 NAPAP54920 295 aa26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF569Q5MCW4 686 aa26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 TMTC1Q8IUR5 882 aa26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 TXLNBQ8N3L3 684 aa26.85■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A0U1RQJ8 604 aa26.84■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 CTAGE9A4FU28 777 aa26.84■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 RPN1P04843 607 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ATRIPQ8WXE1 791 aa26.84■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 USP17L5A8MUK1 530 aa26.84■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP2K7O14733 419 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms