RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM47Q96LD4 638 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 NLRP3Q96P20 1036 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 MYO6Q9UM54 1294 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPNS3-201ENST00000355530 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 KLRC4O43908 158 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 CHP1Q99653 195 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 SBF2Q86WG5 1849 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPNS3-201ENST00000355530 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 ST5P78524 1137 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 BARHL2Q9NY43 387 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 PP2D1A8MPX8 630 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 DNM2P50570 870 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 INF2Q27J81 1249 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 TTI2Q6NXR4 508 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 L1RE1Q9UN81 338 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 H3BQF6 201 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 STXBP3O00186 592 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.46■□□□□ 0.87
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SPNS3-201ENST00000355530 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.46■□□□□ 0.87
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SPNS3-201ENST00000355530 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.45■□□□□ 0.86
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SPNS3-201ENST00000355530 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.45■□□□□ 0.86
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SPNS3-201ENST00000355530 NEK11Q8NG66 645 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 ABCB6Q9NP58 842 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 FLT1P17948 1338 aa20.44■□□□□ 0.86
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SPNS3-201ENST00000355530 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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SPNS3-201ENST00000355530 EXOC1Q9NV70 894 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 CYTH3O43739 400 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 HERVK_113P62684 666 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 WDR93Q6P2C0 686 aa20.44■□□□□ 0.86
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SPNS3-201ENST00000355530 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 SETDB2Q96T68 719 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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SPNS3-201ENST00000355530 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 NARFQ9UHQ1 456 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 JAG2Q9Y219 1238 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS3-201ENST00000355530 USP17L3A6NCW0 530 aa20.42■□□□□ 0.86
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