RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344548.7

CDC42-202, Transcript of cell division cycle 42, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42, Length 2,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-202ENST00000344548 ISM2Q6H9L7 571 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 CBX8Q9HC52 389 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP25Q9UHP3 1055 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 BIN1O00499 593 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 CTAGE5O15320 804 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 TRAPPC10P48553 1259 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 PNOCQ13519 176 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 GALNT17Q6IS24 598 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 DCAF4Q8WV16 495 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 C6orf50Q9HD87 102 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.5■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 TMEM232C9JQI7 657 aa15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 EPS15P42566 896 aa15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 DGKZQ13574 1117 aa15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 GMCL1Q96IK5 515 aa15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 SYT17Q9BSW7 474 aa15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 SERTAD1Q9UHV2 236 aa15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 TMX2Q9Y320 296 aa15.49■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 ESYT2A0FGR8 921 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.072e-8■■□□□ 11.7
CDC42-202ENST00000344548 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 DLK2Q6UY11 383 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 PRR29P0C7W0 189 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 BMP3P12645 472 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 GNA11P29992 359 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 TBCKQ8TEA7 893 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 SBF1O95248 1867 aa15.48■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 ZNF165P49910 485 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 LETM2Q2VYF4 491 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 TIGD1Q96MW7 591 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L15C9J2P7 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L11C9JVI0 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L18D6R9N7 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L22D6RA61 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L19D6RCP7 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L20D6RJB6 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 LMNB1P20700 586 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L24Q0WX57 530 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 CNNM3Q8NE01 707 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 GPRC5DQ9NZD1 345 aa15.47■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 PP2D1A8MPX8 630 aa15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 CASP1P29466 404 aa15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 INPP5BP32019 993 aa15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 TNNI2P48788 182 aa15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 ADCY7P51828 1080 aa15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 IQCB1Q15051 598 aa15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.079e-8■■■■□ 26.4
CDC42-202ENST00000344548 FERMT2Q96AC1 680 aa15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.46■□□□□ 0.07
CDC42-202ENST00000344548 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 DHX58Q96C10 678 aa15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.46■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 BMP6P22004 513 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 UVSSAQ2YD98 709 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 USH1GQ495M9 461 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 OPLAHO14841 1288 aa15.45■□□□□ 0.06
CDC42-202ENST00000344548 TDP2O95551 362 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms