RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 PIGSQ96S52 555 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAI1Q9UI46 699 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SMCO2A6NFE2 343 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RIMBP2O15034 1052 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 OR52Z1P0C646 297 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 PRCPP42785 496 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RBL2Q08999 1139 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNB1Q14721 858 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TXNRD1Q16881 649 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 C6orf50Q9HD87 102 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SNHG28P0DPA3 235 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GNA11P29992 359 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 MFAP3LO75121 409 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 MYL1P05976 194 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 AKR1B1P15121 316 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 UBA7P41226 1012 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 PICALMQ13492 652 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 FILIP1LQ4L180 1135 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ADSSL1Q8N142 457 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SRGNP10124 158 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 FECHP22830 423 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SPAG1Q07617 926 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ELF2Q15723 593 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 NEK8Q86SG6 692 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 AK8Q96MA6 479 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GYPCP04921 128 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 MTF1Q14872 753 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 LETM2Q2VYF4 491 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SIPA1L1O43166 1804 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 MYH4Q9Y623 1939 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.39■■□□□ 1.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 F8W031 263 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 RHOBTB3O94955 611 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 DESI2Q9BSY9 194 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CUEDC2Q9H467 287 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNJ18B7U540 433 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 PLCG1P19174 1290 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SEMA3FQ13275 785 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNJ12Q14500 433 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SOGA3Q5TF21 947 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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KCNQ1-202ENST00000335475 CABP7Q86V35 215 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 TBCKQ8TEA7 893 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 PLIN2Q99541 437 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 MXD3Q9BW11 206 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 NPR1P16066 1061 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR24Q96S15 920 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM260Q9NX78 707 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 N4BP3O15049 544 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 EDIL3O43854 480 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CASP14P31944 242 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SHMT1P34896 483 aa23.37■■□□□ 1.33
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