RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 COA7Q96BR5 231 aa22.63■■□□□ 1.21
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CCDC71-201ENST00000321895 ELP1O95163 1332 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 MYPNQ86TC9 1320 aa22.57■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.55■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.55■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.55■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
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CCDC71-201ENST00000321895 VWA5AO00534 786 aa22.54■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 KIF3CO14782 793 aa22.54■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 ZBED4O75132 1171 aa22.54■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 YEATS4O95619 227 aa22.54■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 TRAPPC10P48553 1259 aa22.54■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCDC71-201ENST00000321895 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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