RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 MEA1Q16626 185 aa24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.95■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNS2Q63HR2 1409 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF263O14978 683 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 CREG2Q8IUH2 290 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 EHD2Q9NZN4 543 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAMM50Q9Y512 469 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTYH3Q9C0H2 523 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 EBAG9O00559 213 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 NMT2O60551 498 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERLIN2O94905 339 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNGT1P63211 74 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP2R5BQ15173 497 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCF2Q9UG63 623 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRIN2DO15399 1336 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLD4Q9HCU8 107 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH10P35580 1976 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 CXCR5P32302 372 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPFIA1Q13136 1202 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 DEF6Q9H4E7 631 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCCP43146 1447 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRGNP10124 158 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXW10Q5XX13 1052 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARL8AQ96BM9 186 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.92■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNM2P50570 870 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF5AQ12840 1032 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXOC1Q9NV70 894 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANO9A1A5B4 782 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLRC4O43908 158 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 YY1AP1Q9H869 796 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 DISC1Q9NRI5 854 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNX12Q9UMY4 172 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 DISP2A7MBM2 1401 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 STARD3NLO95772 234 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC96Q2M329 555 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTI2Q6NXR4 508 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC15Q8TF66 581 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 THAP9Q9H5L6 903 aa24.9■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIGBQ92521 554 aa24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 DOCK2Q92608 1830 aa24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH3P11055 1940 aa24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTMPQ5BVD1 217 aa24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 BRINP3Q76B58 766 aa24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.89■■□□□ 1.58
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCORQ6W2J9 1755 aa24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 MOCS3O95396 460 aa24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL2RBP14784 551 aa24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.89■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAPPAQ13219 1627 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCG2P13521 617 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 VAV2P52735 878 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBED6P86452 979 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMA7O14818 248 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQCA1Q86XH1 822 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH3GL2Q99962 352 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms