RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 TLL1O43897 1013 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 FDX1P10109 184 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 RFC2P35250 354 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC4A3P48751 1232 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 RABGGTBP53611 331 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL23P55773 120 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFAIP2Q03169 654 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 RETREG2Q8NC44 543 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 UIMC1Q96RL1 719 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM50BQ9Y247 325 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.45□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 MYADML2A6NDP7 307 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP2A1O14983 1001 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CA3P07451 260 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ6P48051 423 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX3-2P78367 333 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMCX2Q7L311 632 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CPXCR1Q8N123 301 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9Y3F1 56 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L12C9JPN9 530 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L21D6R901 530 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR1B1P15121 316 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 MRE11P49959 708 aa9.44□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
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PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD50Q92878 1312 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF536O15090 1300 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 BAIAP3O94812 1187 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE6AP16499 860 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK8P49336 464 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP8B2P98198 1209 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 BFSP2Q13515 415 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 GJD3Q8N144 294 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SSH3Q8TE77 659 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX27Q96L92 541 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CRBNQ96SW2 442 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ACAD9Q9H845 621 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 FEM1BQ9UK73 627 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 NOD1Q9Y239 953 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 COG6Q9Y2V7 657 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 B4GALT4O60513 344 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOGP15173 224 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 CPT1AP50416 773 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-201ENST00000296642 BEX3Q00994 111 aa9.42□□□□□ -0.9
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