RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.66■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 FECHP22830 423 aa24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 PLA2G4AP47712 749 aa24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 DPYDQ12882 1025 aa24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 DHX58Q96C10 678 aa24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 SHISA4Q96DD7 197 aa24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 USP49Q70CQ1 688 aa24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 GOLGA1Q92805 767 aa24.65■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.64■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 NOVP48745 357 aa24.64■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.64■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.64■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 STX8Q9UNK0 236 aa24.64■■□□□ 1.54
C6orf136-201ENST00000293604 F8W031 263 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CALML3P27482 149 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 TRAPPC10P48553 1259 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 PTPN21Q16825 1174 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 GABPAQ06546 454 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CNGA4Q8IV77 575 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 TNFRSF25Q93038 417 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SWAP70Q9UH65 585 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.63■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 A0A087X0B3 334 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 ATP2B1P20020 1258 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 USP40Q9NVE5 1235 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 MFAP3LO75121 409 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SPAG1Q07617 926 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 NPY5RQ15761 445 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 TEX35Q5T0J7 233 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.62■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.61■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.61■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 POTEB2H3BUK9 544 aa24.61■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 TTC38Q5R3I4 469 aa24.61■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.61■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 EPSTI1Q96J88 318 aa24.61■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 KIF5CO60282 957 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SMARCA1P28370 1054 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CHRNA5P30532 468 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 NLRP5P59047 1200 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 PICALMQ13492 652 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 TRIM14Q14142 442 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 ECE2O60344 883 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 RBL2Q08999 1139 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 BRD3Q15059 726 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 MXD3Q9BW11 206 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 MYH8P13535 1937 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 TEX33O43247 280 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CYP2C19P33261 490 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 TXLNAP40222 546 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 AFMP43652 599 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CRKP46108 304 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SCNN1DP51172 638 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 DACT2Q5SW24 774 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 GALNT17Q6IS24 598 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CEP112Q8N8E3 955 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 IQUBQ8NA54 791 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 DESI2Q9BSY9 194 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.59■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 FAM205CA6NFA0 338 aa24.58■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.58■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.58■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 TBC1D8O95759 1140 aa24.58■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.58■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CEP95Q96GE4 821 aa24.58■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 ST7Q9NRC1 585 aa24.58■■□□□ 1.53
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC151A5D8V7 595 aa24.58■■□□□ 1.52
C6orf136-201ENST00000293604 HLA-DOAP06340 250 aa24.58■■□□□ 1.52
C6orf136-201ENST00000293604 BAG6P46379 1132 aa24.58■■□□□ 1.52
C6orf136-201ENST00000293604 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
C6orf136-201ENST00000293604 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.58■■□□□ 1.52
C6orf136-201ENST00000293604 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.58■■□□□ 1.52
C6orf136-201ENST00000293604 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.58■■□□□ 1.52
C6orf136-201ENST00000293604 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms