RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 USP17L11C9JVI0 530 aa12.57□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 USP17L18D6R9N7 530 aa12.57□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 USP17L22D6RA61 530 aa12.57□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 USP17L17D6RBQ6 530 aa12.57□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 USP17L19D6RCP7 530 aa12.57□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 USP17L20D6RJB6 530 aa12.57□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 TRPA1O75762 1119 aa12.57□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 USP17L24Q0WX57 530 aa12.57□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.57□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 CRHR2Q13324 411 aa12.56□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 CUL4AQ13619 759 aa12.56□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 FEM1BQ9UK73 627 aa12.56□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 BECN1Q14457 450 aa12.55□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 MUM1L1Q5H9M0 696 aa12.55□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 FERMT3Q86UX7 667 aa12.55□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 FAM184AQ8NB25 1140 aa12.55□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.55□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 BTNL9Q6UXG8 535 aa12.54□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa12.54□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 MAP3K14Q99558 947 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 EFCC1Q9HA90 598 aa12.54□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 OPLAHO14841 1288 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 CNMDO75829 334 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 SCG2P13521 617 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 UBE2SQ16763 222 aa12.54□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 USP17L6PQ6QN14 398 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 REPS2Q8NFH8 660 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 OXER1Q8TDS5 423 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 HOXC10Q9NYD6 342 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 LBX2Q6XYB7 198 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD23Q86SG2 305 aa12.53□□□□□ -0.4
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TTPA-201ENST00000260116 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 SYT1P21579 422 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 NAPAP54920 295 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 NR5A1Q13285 461 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPA-201ENST00000260116 FAM160B2Q86V87 743 aa12.53□□□□□ -0.4
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