RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088356.9

Usf3-201, Transcript of Gene model 608, (NCBI), mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Usf3, Length 757 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3-201ENSMUST00000088356 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Tlk2O55047 718 aa20.58■□□□□ 0.89
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Kcnh8P59111 1102 aa20.58■□□□□ 0.89
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Usf3-201ENSMUST00000088356 NapbP28663 298 aa20.55■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Eepd1Q3TGW2 569 aa20.55■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kctd1Q5M956 257 aa20.55■□□□□ 0.88
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Usf3-201ENSMUST00000088356 FanclQ9CR14 375 aa20.55■□□□□ 0.88
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Usf3-201ENSMUST00000088356 PolkQ9QUG2 852 aa20.55■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Clip2Q9Z0H8 1047 aa20.55■□□□□ 0.88
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa20.54■□□□□ 0.88
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Snx29Q9D3S3 818 aa20.54■□□□□ 0.88
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Usf3-201ENSMUST00000088356 PrelpQ9JK53 378 aa20.53■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa20.53■□□□□ 0.88
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Usf3-201ENSMUST00000088356 PtprcapQ64697 197 aa20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fbxo10Q7TQF2 950 aa20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 BC048507Q80ZS7 89 aa20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Arhgef6Q8K4I3 771 aa20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pus10Q9D3U0 527 aa20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Clstn1Q9EPL2 979 aa20.52■□□□□ 0.88
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm15448F6PZL4 682 aa20.51■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Etaa1Q5SVT3 877 aa20.51■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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Usf3-201ENSMUST00000088356 Sbf2E9PXF8 1872 aa20.51■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pde11aP0C1Q2 933 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 OatP29758 439 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rnf19aP50636 840 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 L3mbtl2P59178 703 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tcaf3Q6QR59 914 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tekt3Q6X6Z7 490 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Crb2Q80YA8 1282 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ccdc178Q8CDV0 866 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zcchc18Q8VD24 393 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Arhgef25Q9CWR0 618 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Arid3bQ9Z1N7 568 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sept3Q9Z1S5 350 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa20.5■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa20.49■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Il13ra2O88786 383 aa20.49■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 RabggtbP53612 339 aa20.49■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trappc3lQ4KL14 181 aa20.49■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Xkr5Q5GH66 676 aa20.49■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dis3lQ8C0S1 1053 aa20.49■□□□□ 0.87
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