RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.73	□□□□□ -1.49	not detected
PSH1	YOL054W	SMC5	Q08204	1093 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TAF3	Q12297	353 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TRM11	Q12463	433 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	NKP1	Q12493	238 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ECM3	Q99252	613 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MSM1	P22438	575 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YBP1	P38315	674 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	TSC10	P38342	320 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ACA1	P39970	489 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YIL089W	P40500	205 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YJL107C	P42947	387 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	QRI7	P43122	407 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	HOP2	P53187	214 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	COX18	P53239	316 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RTT102	P53330	157 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YML037C	Q03703	340 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	MCM21	Q06675	368 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	IES4	Q08561	116 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	YOL114C	Q12322	202 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	AVL9	Q12500	764 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	DFG16	Q99234	619 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PSH1	YOL054W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	IMA3	P0CW40	589 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	IMA4	P0CW41	589 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CDC26	P14724	124 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	HOP1	P20050	605 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	URA4	P20051	364 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	AAD3	P25612	363 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	VPH2	P32341	215 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CBF2	P32504	956 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PET127	P32606	800 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	STV1	P37296	890 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ETR1	P38071	380 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TDA11	P38854	504 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	STN1	P38960	494 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	STL1	P39932	569 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	GID8	P40208	455 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	FMP33	P46998	180 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SPT20	P50875	604 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RCF2	P53721	224 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	OSH6	Q02201	448 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	NRG1	Q03125	231 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ACL4	Q03771	387 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	COQ9	Q05779	260 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YPS7	Q06325	596 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	IMA2	Q08295	589 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RUP1	Q12242	671 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MOT1	P32333	1867 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	LAA1	P39526	2014 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SLY1	P22213	666 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RRT12	P25381	491 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	AST1	P35183	429 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	HES1	P35843	434 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SWC5	P38326	303 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RPP1	P38786	293 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	FRT2	P39734	528 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	EAF5	P39995	279 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SNZ3	P43545	298 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SAD1	P43589	448 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ORC5	P50874	479 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	BIO4	P53630	237 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SNZ2	P53824	298 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PPN1	Q04119	674 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YET3	Q07451	203 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MSS18	P08593	268 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YAK1	P14680	807 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.69	□□□□□ -1.5	not detected
PSH1	YOL054W	TYR1	P20049	452 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	KIN82	P25341	720 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	DBF20	P32328	564 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PEX2	P32800	271 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	GYP6	P32806	458 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	BCS1	P32839	456 aa		5.69	□□□□□ -1.5

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