RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YEH2Q07950 538 aa2.67□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A PDH1Q12428 516 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A SET6Q12529 373 aa2.67□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A SNF3P10870 884 aa2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A TFC3P34111 1160 aa2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A ANS1P38832 159 aa2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A FAF1P40546 346 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A COS10P52924 374 aa2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A YNR061CP53747 219 aa2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A RPM2Q02773 1202 aa2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A ATG9Q12142 997 aa2.66□□□□□ -1.98
YMR001C-AYMR001C-A LCB1P25045 558 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A PGS1P25578 521 aa2.65□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A PTP2P29461 750 aa2.65□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A PSF2P40359 213 aa2.65□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A RTT101P47050 842 aa2.65□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A STR3P53101 465 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A YMR087WQ04299 284 aa2.65□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A YOR019WQ99248 730 aa2.65□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A TPK1P06244 397 aa2.64□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A RPS2P25443 254 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A NDC1P32500 655 aa2.64□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SLX1P38324 304 aa2.64□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A YHL041WP38730 149 aa2.64□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A PFK26P40433 827 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A DIC1Q06143 298 aa2.64□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A HXK2P04807 486 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A UBA4P38820 440 aa2.63□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A PKP1P40530 394 aa2.63□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A BSC6Q08280 497 aa2.63□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A AYT1Q12226 474 aa2.63□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A ARP6Q12509 438 aa2.63□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A TYR1P20049 452 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SEC62P21825 274 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A PTR2P32901 601 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A IFA38P38286 347 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A MTC4P38335 694 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A TIF5P38431 405 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A PSD1P39006 500 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A YJL132WP47014 750 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A REG1Q00816 1014 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A ERP1Q05359 219 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A APL4Q12028 832 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A NUC1P08466 329 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A MTF1P14908 341 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A ERG8P24521 451 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A YCL049CP25577 312 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SPC110P32380 944 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A MRPL36P36531 177 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A NPR3P38742 1146 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A RPS10BP46784 105 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A DPB11P47027 764 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SMC3P47037 1230 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SAM50P53969 484 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A CSR1Q06705 408 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A CDC45Q08032 650 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A ERG27Q12452 347 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A VCX1Q99385 411 aa2.61□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A HEM2P05373 342 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A ECM15P35195 104 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A ROT2P38138 954 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A RRT2P38332 387 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SEC24P40482 926 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A CIA1Q05583 330 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SSK1Q07084 712 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A THI20Q08224 551 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A INP53Q12271 1107 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A CDC15P27636 974 aa2.59□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A SNC1P31109 117 aa2.59□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A VPS17P32913 551 aa2.59□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A YGL082WP53155 381 aa2.59□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A GRC3Q07845 632 aa2.59□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A PSK2Q08217 1101 aa2.59□□□□□ -1.99
YMR001C-AYMR001C-A APA1P16550 321 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A PHO81P17442 1178 aa2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A RAD16P31244 790 aa2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YKL050CP35736 922 aa2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A VPS52P39904 641 aa2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A PRE5P40302 234 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YTA12P40341 825 aa2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A IME4P41833 600 aa2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A IDP2P41939 412 aa2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YPL014WQ02606 381 aa2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A EMI2Q04409 500 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A SGV1P23293 657 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YCR022CP25620 114 aa2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A CMK1P27466 446 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YNK1P36010 153 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A PYK2P52489 506 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
YMR001C-AYMR001C-A YGL242CP53066 181 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.9 ms