RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ICA1	Q05084	483 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	TTC38	Q5R3I4	469 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	GALNT17	Q6IS24	598 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	SDF4	Q9BRK5	362 aa		18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	18.24	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	MYH4	Q9Y623	1939 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	MYO1B	O43795	1136 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	GH2	P01242	217 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	TRAPPC10	P48553	1259 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	NAPA	P54920	295 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF174	Q15697	407 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC96	Q2M329	555 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	SPECC1	Q5M775	1068 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	SYK	P43405	635 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	KCTD1	Q719H9	257 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	BMP15	O95972	392 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	UVSSA	Q2YD98	709 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	FAM83A	Q86UY5	434 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		18.22	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	RAD21	O60216	631 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	EGFR	P00533	1210 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	SLC16A2	P36021	539 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		18.21	■□□□□ 0.51
DNM1-222	ENST00000636280	SMCO2	A6NFE2	343 aa		18.21	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	SLFN13	Q68D06	897 aa		18.21	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	FZD9	O00144	591 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	TPM2	P07951	284 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	SLC1A4	P43007	532 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	PTGDR	Q13258	359 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	TIGD1	Q96MW7	591 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	CSRNP2	Q9H175	543 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	C6orf50	Q9HD87	102 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	DCAF4	Q8WV16	495 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		18.2	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280		F5H6K3	240 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	GNA11	P29992	359 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	MCM7	P33993	719 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	KLRC3	Q07444	240 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	COA7	Q96BR5	231 aa		18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	USP17L10	C9JJH3	530 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	MMP14	P50281	582 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	USP49	Q70CQ1	688 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	FERMT2	Q96AC1	680 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	ESYT2	A0FGR8	921 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	MICALL2	Q8IY33	904 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	MTMR8	Q96EF0	704 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		18.18	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280		A0A087WWV3	80 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1W2PRG0	241 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	TBC1D12	O60347	775 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	NDUFB10	O96000	172 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	STX1A	Q16623	288 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	INF2	Q27J81	1249 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	LONRF3	Q496Y0	759 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	DPF2	Q92785	391 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	CBX8	Q9HC52	389 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	SPON1	Q9HCB6	807 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		18.17	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	ZBTB5	O15062	677 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	RASA3	Q14644	834 aa		18.16	■□□□□ 0.5
DNM1-222	ENST00000636280	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		18.16	■□□□□ 0.5

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