RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636010.1

SPTAN1-229, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 1,472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-229	ENST00000636010	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	CPA1	P15085	419 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	ELN	P15502	786 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	ERCC3	P19447	782 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	HSPA4	P34932	840 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	STAT2	P52630	851 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZNF536	O15090	1300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	PRC1	O43663	620 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	GNRH1	P01148	92 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	USP6NL	Q92738	828 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	COA7	Q96BR5	231 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	SEC24B	O95487	1268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	CYP2B6	P20813	491 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	MAPK4	P31152	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	NT5C2	P49902	561 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	TRIM32	Q13049	653 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	CCL14	Q16627	93 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	MORN1	Q5T089	497 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	KCNB2	Q92953	911 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	ADCY3	O60266	1144 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	PLA2G6	O60733	806 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	PTPRE	P23469	700 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	HOXD10	P28358	340 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	STAT3	P40763	770 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	PRMT2	P55345	433 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	CCNA1	P78396	465 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	WTAP	Q15007	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	TRIB2	Q92519	343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	ALPK3	Q96L96	1907 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SPTAN1-229	ENST00000636010	REC8	O95072	547 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	GRK4	P32298	578 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	MCM5	P33992	734 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	IRF5	Q13568	498 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	GRB14	Q14449	540 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	MTFR1	Q15390	333 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	COBL	O75128	1261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	ZBED4	O75132	1171 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	RXRA	P19793	462 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPTAN1-229	ENST00000636010	ADORA2A	P29274	412 aa		13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms