RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5JP18859 108 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHB4P54760 987 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 GPATCH3Q96I76 525 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 HAUS7Q99871 368 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 VWA5AO00534 786 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ERC2O15083 957 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP19Q99542 508 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TINF2Q9BSI4 451 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PGK1P00558 417 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SDSP20132 328 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CTR9Q6PD62 1173 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MUC3AQ02505 3323 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH7P12883 1935 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE3CQ15386 1083 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS4O75173 837 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 STAT3P40763 770 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0355O15063 1070 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RARBP10826 455 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM83BQ5T0W9 1011 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQY0 241 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MYLIPQ8WY64 445 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC24BO95487 1268 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CLTBP09497 229 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CASC1Q6TDU7 716 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.182e-6■■□□□ 12.4
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL11AQ9H165 835 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 RIPK3Q9Y572 518 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD2Q14681 263 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF180Q86T96 592 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 GOPCQ9HD26 462 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 AKR1A1P14550 325 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 RASA1P20936 1047 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHDC9Q8NEP7 349 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC28Q96AY4 2481 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 FAAP100Q0VG06 881 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TICAM2Q86XR7 235 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 FGD4Q96M96 766 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 MYADML2A6NDP7 307 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCY6O43306 1168 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 COPB2P35606 906 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SBK1Q52WX2 424 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ACLYP53396 1101 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TOX2Q96NM4 488 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX13BQ9BXU2 312 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NYAP2Q9P242 653 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFB10O96000 172 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM265A0A087WTH1 108 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 F5H6K3 240 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP2A1O14983 1001 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RAG1P15918 1043 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRC3Q07444 240 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX21Q9UL17 535 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CNPY2Q9Y2B0 182 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FPGSQ05932 587 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MCM3APO60318 1980 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD21O60216 631 aa28.55■■■□□ 2.16
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