RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621218.4

PLP1-223, Transcript of proteolipid protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLP1, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-223	ENST00000621218	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	OPA1	O60313	960 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	KRT83	P78385	493 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ATP2B2	Q01814	1243 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	NNT	Q13423	1086 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	SNX12	Q9UMY4	172 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CHD4	Q14839	1912 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CLGN	O14967	610 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	SPAG1	Q07617	926 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	IL17A	Q16552	155 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	LGALS16	A8MUM7	142 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	C21orf2	O43822	256 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	RASSF9	O75901	435 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	KIAA0754	O94854	1291 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	FAM153B	P0C7A2	387 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	PPARD	Q03181	441 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	PKN1	Q16512	942 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	FAM153C	Q494X1	144 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	KLC4	Q9NSK0	619 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	MCM8	Q9UJA3	840 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	NID2	Q14112	1375 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	PDE6A	P16499	860 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	EPHB4	P54760	987 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	PTGDR	Q13258	359 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	FANCB	Q8NB91	859 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	EPN3	Q9H201	632 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ATRN	O75882	1429 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218		A0A1W2PQC6	194 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218		B4DLN1	442 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ALS2CL	Q60I27	953 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	STIM2	Q9P246	746 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	GLI3	P10071	1580 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CHUK	O15111	745 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CYP27B1	O15528	508 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	HSF2BP	O75031	334 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	FERMT2	Q96AC1	680 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	VCPKMT	Q9H867	229 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		10.27	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
PLP1-223	ENST00000621218		H7C1D1	291 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ADAMTS3	O15072	1205 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PRKAB2	O43741	272 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	IFT88	Q13099	833 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	WTAP	Q15007	396 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	EMB	Q6PCB8	327 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		10.27	□□□□□ -0.77

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