RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 PANK4Q9NVE7 773 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GPR108Q9NPR9 543 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SSH2Q76I76 1423 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ABL1P00519 1130 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 RRAGAQ7L523 313 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 VPS18Q9P253 973 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PFKFB2O60825 505 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PROSER3Q2NL68 480 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 CAPN9O14815 690 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 DTNBO60941 627 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TFDP1Q14186 410 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.27■■□□□ 1.16
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CTDP1-208ENST00000613122 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 CASC4Q6P4E1 433 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 HDXQ7Z353 690 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SESTD1Q86VW0 696 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TTLL1O95922 423 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KCNQ4P56696 695 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 PEX26Q7Z412 305 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 DAAM2Q86T65 1068 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 RSPH3Q86UC2 560 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 STAT1P42224 750 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 EVCP57679 992 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ADALQ6DHV7 355 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC89Q8N998 374 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ATP7BP35670 1465 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 CAPN2P17655 700 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF75DP51815 510 aa22.25■■□□□ 1.15
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CTDP1-208ENST00000613122 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 TSKSQ9UJT2 592 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 RAD17O75943 681 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF11Q86T75 865 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ADCY9O60503 1353 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 LONRF3Q496Y0 759 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 VPS52Q8N1B4 723 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 HESX1Q9UBX0 185 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KDM5CP41229 1560 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 PFKFB1P16118 471 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 HSPA1LP34931 641 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 USP6P35125 1406 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KRT81Q14533 505 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 OATP04181 439 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 NPR1P16066 1061 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 LGSNQ5TDP6 509 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 FYB2Q5VWT5 728 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB9Q96C00 473 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 GDF11O95390 407 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KIF11P52732 1056 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM50Q86XT4 487 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 ABI1Q8IZP0 508 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 STAM2O75886 525 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-208ENST00000613122 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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