RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SRRDQ9UH36 339 aa3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TLR6Q9Y2C9 796 aa3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa3.5□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM82A0PJX8 343 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SUV39H1O43463 412 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HTR3BO95264 441 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRKCAP17252 672 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NR1I3Q14994 352 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AEBP1Q8IUX7 1158 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PHC3Q8NDX5 983 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NUP43Q8NFH3 380 aa3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A1W2PQY0 241 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RGS13O14921 159 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BRD1O95696 1058 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAG1P15918 1043 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LIMS1P48059 325 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LMNB2Q03252 620 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BBS9Q3SYG4 887 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZPBP2Q6X784 338 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GATAD2BQ8WXI9 593 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CDADC1Q9BWV3 514 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.48□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRR36Q9H6K5 1346 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A1W2PQJ5 194 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FFAR3O14843 346 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SIGLEC6O43699 453 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GRIN3BO60391 1043 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRAMEF1O95521 474 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 F13A1P00488 732 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAPKAPK2P49137 400 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZXDAP98168 799 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KIR3DS1Q14943 382 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MEI1Q5TIA1 1274 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RPTNQ6XPR3 784 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FERMT3Q86UX7 667 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VWCEQ96DN2 955 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.47□□□□□ -1.85
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM221AA4D161 298 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MSL3P1P0C860 447 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ST13P50502 369 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NBPF9Q3BBW0 867 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LIPIQ6XZB0 460 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLCO6A1Q86UG4 719 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RELL1Q8IUW5 271 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NAT16Q8N8M0 369 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CRELD1Q96HD1 420 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARID3AQ99856 593 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPATA25Q9BR10 227 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CHST7Q9NS84 486 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa3.46□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IRS2Q9Y4H2 1338 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MEIS1O00470 390 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CLEC3AO75596 197 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UBOX5O94941 541 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PF4P02776 101 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TNFRSF1AP19438 455 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CNR2P34972 360 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GJA9P57773 515 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADAM17P78536 824 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PWP1Q13610 501 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MPP2Q14168 576 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARSHQ5FYA8 562 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SNAP47Q5SQN1 464 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 JAMLQ86YT9 394 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.45□□□□□ -1.86
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.7 ms