RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPATA1Q5VX52 437 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEP135Q66GS9 1140 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP40Q9NVE5 1235 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DOK7Q18PE1 504 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 INF2Q27J81 1249 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH1P12882 1939 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRPHP41219 470 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP7D2Q96T17 732 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RMND1Q9NWS8 449 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMCO2A6NFE2 343 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP27XA6NNY8 438 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CUL4BQ13620 913 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HOMER1Q86YM7 354 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TEKT1Q969V4 418 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCP110O43303 1012 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MED15Q96RN5 788 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L5A8MUK1 530 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM232C9JQI7 657 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HLA-DOAP06340 250 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDHBP11177 359 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CASP1P29466 404 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STAT6P42226 847 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PODNQ7Z5L7 613 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 INTS13Q9NVM9 706 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOCADQ5VW36 1801 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ESYT2A0FGR8 921 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CPVLQ9H3G5 476 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DISC1Q9NRI5 854 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTLL1O95922 423 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBA7P41226 1012 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PIGSQ96S52 555 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EP400Q96L91 3159 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TUBB4AP04350 444 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AKR1B1P15121 316 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCNN1DP51172 638 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STAMQ92783 540 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AK8Q96MA6 479 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMX1Q9H3N1 280 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYL1P05976 194 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNHG28P0DPA3 235 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MXD3Q9BW11 206 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRIQ9BWK5 157 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1B0GTH6 734 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SEMA3FQ13275 785 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NR1I3Q14994 352 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEK8Q86SG6 692 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF592Q92610 1267 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTRQ99707 1265 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms