RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 ESR2Q92731 530 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 SLC1A4P43007 532 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 STAT2P52630 851 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 OAZ1P54368 228 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 CCL14Q16627 93 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 FAM160B2Q86V87 743 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 TTC14Q96N46 770 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 DEFB118Q96PH6 123 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 FCER1AP12319 257 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
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HERC3-214ENST00000601319 KIFC2Q96AC6 838 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 ALPK3Q96L96 1907 aa20.27■□□□□ 0.84
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HERC3-214ENST00000601319 ZBED4O75132 1171 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 DPP9Q86TI2 863 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 TMEM232C9JQI7 657 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 MCCP23508 829 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 MYH6P13533 1939 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 COBLO75128 1261 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 KCTD2Q14681 263 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 DGKHQ86XP1 1220 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 MMP19Q99542 508 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 KRT23Q9C075 422 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 LCTP09848 1927 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 KDM4AO75164 1064 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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HERC3-214ENST00000601319 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 IQCA1Q86XH1 822 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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HERC3-214ENST00000601319 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.22■□□□□ 0.83
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HERC3-214ENST00000601319 ANKS1AQ92625 1134 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 MAML3Q96JK9 1138 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 FBXO40Q9UH90 709 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 RIPK3Q9Y572 518 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CEP290O15078 2479 aa20.22■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 B4E1Z4 1266 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 PDHBP11177 359 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CYBAP13498 195 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 PTH1RQ03431 593 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CCDC96Q2M329 555 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CPXCR1Q8N123 301 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 CHST13Q8NET6 341 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.21■□□□□ 0.83
HERC3-214ENST00000601319 ZNF536O15090 1300 aa20.21■□□□□ 0.83
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HERC3-214ENST00000601319 CYP21A2P08686 494 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 CYP2C19P33261 490 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.2■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 ZNF543Q08ER8 600 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 TKFCQ3LXA3 575 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 LHX8Q68G74 356 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 MAP4K1Q92918 833 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 TNKSO95271 1327 aa20.19■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 NEFLP07196 543 aa20.18■□□□□ 0.82
HERC3-214ENST00000601319 PGK2P07205 417 aa20.18■□□□□ 0.82
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