RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 TEX11Q8IYF3 940 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 PARP14Q460N5 1801 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.3□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 POTEB3A0JP26 581 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 EPOPA6NHQ4 379 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 SEPT4O43236 478 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 PDE4AP27815 886 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 ANO1Q5XXA6 986 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 KRT40Q6A162 431 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 POTEBQ6S5H4 581 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 USP40Q9NVE5 1235 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 MSRAQ9UJ68 235 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 RAD50Q92878 1312 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 CEP250Q9BV73 2442 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 FAM196BA6NMK8 535 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 HLA-DOAP06340 250 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 CSF2RAP15509 400 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 PTPREP23469 700 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 USP5P45974 858 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF365Q70YC5 407 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 GJD3Q8N144 294 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 PRSS33Q8NF86 280 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 HLA-CQ95604 372 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 UIMC1Q96RL1 719 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 SCN5AQ14524 2016 aa9.27□□□□□ -0.92
ZNF548-208ENST00000597576 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PQY0 241 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 RFXAPO00287 272 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 CDC45O75419 566 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ACRP10323 421 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ALADP13716 330 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 MYOGP15173 224 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 SDSP20132 328 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 BACE1P56817 501 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ATP2B2Q01814 1243 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.939e-6■■□□□ 12.8
ZNF548-208ENST00000597576 MTMR2Q13614 643 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 WDR18Q9BV38 432 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 MYH7P12883 1935 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 USP17L5A8MUK1 530 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 KRT37O76014 449 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 MBD4O95243 580 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 APPP05067 770 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 CAP2P40123 477 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 RABGGTBP53611 331 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 JAG1P78504 1218 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 TTC6Q86TZ1 520 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 VWCEQ96DN2 955 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 MCM3APO60318 1980 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 SIP14410 1827 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 SPTBN2O15020 2390 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 TET1Q8NFU7 2136 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 GPAA1O43292 621 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 LPXNO60711 386 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-208ENST00000597576 DSG3P32926 999 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms