RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 EREGO14944 169 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 KCNQ3O43525 872 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PCSK2P16519 638 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 TM4SF1P30408 202 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 COL19A1Q14993 1142 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CBLL1Q75N03 491 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 GJD3Q8N144 294 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PRNPP04156 253 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 A0A0G2JLW4 131 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 TNFRSF21O75509 655 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 DPEP1P16444 411 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PRKAR2BP31323 418 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 USP11P51784 963 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PAOXQ6QHF9 649 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 COL15A1P39059 1388 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ATP10DQ9P241 1426 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 FAM170BA6NMN3 283 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 JAG1P78504 1218 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 KCNA1Q09470 495 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ZNF790Q6PG37 636 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 TTC16Q8NEE8 873 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 NARFQ9UHQ1 456 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 METTL12A8MUP2 240 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 CYP26A1O43174 497 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 GRIN3BO60391 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 RFC4P35249 363 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 USP5P45974 858 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 PRELPP51888 382 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 TGFB2P61812 414 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 GSTM4Q03013 218 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 DCTN1Q14203 1278 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 NFIXQ14938 502 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ZAR1Q86SH2 424 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 GATA6Q92908 595 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 PMEPA1Q969W9 287 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 CACNA1SQ13698 1873 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 GPR182O15218 404 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 NDUFB5O43674 189 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 PHACTR2O75167 634 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 IGHA2P01877 340 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 CHRNA5P30532 468 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 C1QTNF8P60827 252 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ORC1Q13415 861 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 MCM10Q7L590 875 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 FBXL18Q96ME1 805 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 USP16Q9Y5T5 823 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 A1BGP04217 495 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 CTSBP07858 339 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 EDN3P14138 238 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ITGB5P18084 799 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 FLCNQ8NFG4 579 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 FAM129BQ96TA1 746 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 NUP98P52948 1817 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms