RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584216.5

COPS3-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 876 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-218ENST00000584216 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 TBX21Q9UL17 535 aa16.06■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 USP17L12C9JPN9 530 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 USP17L21D6R901 530 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ADD2P35612 726 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 USP38Q8NB14 1042 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 IL27Q8NEV9 243 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 VTI1AQ96AJ9 217 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 10.2
COPS3-218ENST00000584216 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 HMMRO75330 724 aa16.04■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 RAB30Q15771 203 aa16.04■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 REPS2Q8NFH8 660 aa16.04■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 THEGQ9P2T0 379 aa16.04■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 MSRAQ9UJ68 235 aa16.04■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 APBB1O00213 710 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 PRKAB2O43741 272 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 RLBP1P12271 317 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 COL9A1P20849 921 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ACVR2BQ13705 512 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 TMEM240Q5SV17 173 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 PBX4Q9BYU1 374 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 FBXO40Q9UH90 709 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ARVCFO00192 962 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ATP2A1O14983 1001 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ZBED4O75132 1171 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ASGR1P07306 291 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 CDK7P50613 346 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 UBE3CQ15386 1083 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 RASIP1Q5U651 963 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 ASB2Q96Q27 587 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS3-218ENST00000584216 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 RAB11FIP3O75154 756 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 CSF2RAP15509 400 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 GJA9P57773 515 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 GNASQ5JWF2 1037 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 PPM1EQ8WY54 764 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 NYAP2Q9P242 653 aa16.01■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 MS4A1P11836 297 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 ATP5JP18859 108 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 CTR9Q6PD62 1173 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 ZNF365Q70YC5 407 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 FAM126BQ8IXS8 530 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 CHST13Q8NET6 341 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 BOLA2Q9H3K6 86 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 MKNK2Q9HBH9 465 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 ZNF287Q9HBT7 754 aa16■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 MYADML2A6NDP7 307 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 F5H6K3 240 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 CABYRO75952 493 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 PBX2P40425 430 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 SLC4A3P48751 1232 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 OAZ1P54368 228 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 KLRC3Q07444 240 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 CPXCR1Q8N123 301 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 HERVK_113Q902F9 699 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 HAUS7Q99871 368 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 IL23AQ9NPF7 189 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 TTC28Q96AY4 2481 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 PARP14Q460N5 1801 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 NDUFB10O96000 172 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 FDX1P10109 184 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 IGFBP4P22692 258 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 ARMCX2Q7L311 632 aa15.98■□□□□ 0.15
COPS3-218ENST00000584216 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms