RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578571.5

PTPRM-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 1,106 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-207ENST00000578571 NAIPQ13075 1403 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 CYP7A1P22680 504 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 VWCEQ96DN2 955 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 AGLP35573 1532 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 PTPRKQ15262 1439 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 KIF3BO15066 747 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 CBX7O95931 251 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 PRNPP04156 253 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 FGRP09769 529 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 GBP1P32455 592 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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PTPRM-207ENST00000578571 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 VPS37DQ86XT2 251 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 MFSD4AQ8N468 514 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 RNF141Q8WVD5 230 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 Q96M66 194 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 GMLQ99445 158 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 TM9SF2Q99805 663 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 ADAMTS4O75173 837 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 CCNFP41002 786 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 KIR3DL1P43629 444 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 ARID5AQ03989 594 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 TMEM192Q8IY95 271 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 C8orf37Q96NL8 207 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 CRBNQ96SW2 442 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-207ENST00000578571 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 LRRN2O75325 713 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 GUCY2CP25092 1073 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 TNK2Q07912 1038 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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PTPRM-207ENST00000578571 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 ASPNQ9BXN1 380 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRM-207ENST00000578571 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-207ENST00000578571 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 FBXL18Q96ME1 805 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 SLC6A18Q96N87 628 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.253e-10■■■■□ 19.3
PTPRM-207ENST00000578571 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRM-207ENST00000578571 UNC13BO14795 1591 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 NUP155O75694 1391 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-207ENST00000578571 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-207ENST00000578571 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-207ENST00000578571 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-207ENST00000578571 A0A1W2PQH9 124 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 CLEC3AO75596 197 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 PRKCQQ04759 706 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 BNIP3Q12983 259 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 SPRED2Q7Z698 418 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 TTC6Q86TZ1 520 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 Q8N3U1 123 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 MISP3Q96FF7 219 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-207ENST00000578571 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.24□□□□□ -1.25
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