RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		19.54	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		19.54	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		19.54	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	19.54	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	19.54	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	19.54	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		19.54	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	TSKS	Q9UJT2	592 aa		19.54	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	MYPN	Q86TC9	1320 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	IFNAR1	P17181	557 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	CDC27	P30260	824 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	TM4SF4	P48230	202 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		19.53	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	LARGE1	O95461	756 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	OSBP	P22059	807 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	MAP2K2	P36507	400 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	CUL4A	Q13619	759 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	NTRK3	Q16288	839 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	NECAB1	Q8N987	351 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	PNMA3	Q9UL41	463 aa		19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
TBCD-223	ENST00000576691	PTPRF	P10586	1907 aa		19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	BTBD19	C9JJ37	291 aa		19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	FLOT1	O75955	427 aa		19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	DGKZ	Q13574	1117 aa		19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	TREML2	Q5T2D2	321 aa		19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	FUT2	Q10981	343 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	PTPN18	Q99952	460 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	PNMA2	Q9UL42	364 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		19.5	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	PDHX	O00330	501 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	DSG3	P32926	999 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	TRAF1	Q13077	416 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	LBX2	Q6XYB7	198 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	MTMR8	Q96EF0	704 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		19.49	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	CYTH3	O43739	400 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ALDH1A1	P00352	501 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	SLC16A2	P36021	539 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	NBPF11	Q86T75	865 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	IFNL1	Q8IU54	200 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	MB21D1	Q8N884	522 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	KIFC2	Q96AC6	838 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ABHD8	Q96I13	439 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		19.48	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	CA12	O43570	354 aa		19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ZBED4	O75132	1171 aa		19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	CTDNEP1	O95476	244 aa		19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ST3GAL1	Q11201	340 aa		19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	STK36	Q9NRP7	1315 aa		19.47	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		19.46	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	VWA5A	O00534	786 aa		19.46	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	ZBTB5	O15062	677 aa		19.46	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	OAZ1	P54368	228 aa		19.46	■□□□□ 0.71
TBCD-223	ENST00000576691	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms