RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, humanhuman

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1-208ENST00000576557 MYH7P12883 1935 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 AKR1A1P14550 325 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 KIAA0355O15063 1070 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 ADAMTS4O75173 837 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 ACLYP53396 1101 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 AAMPQ13685 434 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 DDX11Q96FC9 970 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 RIPK3Q9Y572 518 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 F5H6K3 240 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 FOSL2P15408 326 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 RASA1P20936 1047 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 COPB2P35606 906 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 FPGSQ05932 587 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 KLRC3Q07444 240 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 KCNA10Q16322 511 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 CPXCR1Q8N123 301 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 MYADML2A6NDP7 307 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 NDUFB10O96000 172 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 FAAP100Q0VG06 881 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 MCM3APO60318 1980 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 ZBED4O75132 1171 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 SBK1Q52WX2 424 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 KIFC2Q96AC6 838 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 NYAP2Q9P242 653 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC1-208ENST00000576557 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 PRDM1O75626 825 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 GRIN2CQ14957 1233 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 OSBP2Q969R2 916 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 TOX2Q96NM4 488 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 MYH4Q9Y623 1939 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 TIMP1P01033 207 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ACVR2BQ13705 512 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.071e-8■□□□□ 11.2
ABCC1-208ENST00000576557 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ADCY6O43306 1168 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 APPP05067 770 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ASGR1P07306 291 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 DNAJB2P25686 324 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 TDO2P48775 406 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 FGD4Q96M96 766 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 TBX21Q9UL17 535 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 VCANP13611 3396 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 ATP2A1O14983 1001 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCC1-208ENST00000576557 CDK7P50613 346 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms