RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 PBX4Q9BYU1 374 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 MYH7P12883 1935 aa21.11■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 COPB2P35606 906 aa21.1■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 MFSD5Q6N075 450 aa21.1■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.1■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.1■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.1■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 ACRP10323 421 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 ADD2P35612 726 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM240Q5SV17 173 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 DDX11Q96FC9 970 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 RIPK3Q9Y572 518 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 GBF1Q92538 1859 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 ADCY6O43306 1168 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 CSF2RAP15509 400 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC40-211ENST00000574099 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ASGR1P07306 291 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CPXCR1Q8N123 301 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 THEGQ9P2T0 379 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CCER2I3L3R5 266 aa21.06■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ACVR2BQ13705 512 aa21.06■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC174Q6PII3 467 aa21.06■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF365Q70YC5 407 aa21.06■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 PANK1Q8TE04 598 aa21.06■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.06■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ELP1O95163 1332 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 MYO9BQ13459 2157 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 IGFBP4P22692 258 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CDK7P50613 346 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CTR9Q6PD62 1173 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM199Q8N511 208 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 MYH4Q9Y623 1939 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ARVCFO00192 962 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRE1Q14246 886 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 RASIP1Q5U651 963 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ASB2Q96Q27 587 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 SPC25Q9HBM1 224 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFB10O96000 172 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CYP2C18P33260 490 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 GNASQ5JWF2 1037 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 FGD4Q96M96 766 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 GJA9P57773 515 aa21.02■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ARMCX2Q7L311 632 aa21.02■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.02■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 KIFC2Q96AC6 838 aa21.02■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CCDC40-211ENST00000574099 MSRAQ9UJ68 235 aa21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms