RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 BADQ92934 168 aa25.13■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.13■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 RIPK3Q9Y572 518 aa25.13■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.12■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 APPP05067 770 aa25.12■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 TLE2Q04725 743 aa25.12■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 SHHQ15465 462 aa25.12■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ATP2A1O14983 1001 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 DDX11Q96FC9 970 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 CEP95Q96GE4 821 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 GUCD1Q96NT3 240 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.11■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 A0A1W2PQY0 241 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ZBED4O75132 1171 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ADAMTS4O75173 837 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 SLC4A3P48751 1232 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 CPXCR1Q8N123 301 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 MKL1Q969V6 931 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 KIFC2Q96AC6 838 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 TTLL1O95922 423 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 CLTBP09497 229 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 FAM161BQ96MY7 647 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 FEM1BQ9UK73 627 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.09■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.08■■□□□ 1.61
STX4-216ENST00000566353 ERC2O15083 957 aa25.07■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.07■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 FSD1Q9BTV5 496 aa25.07■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 MCM3APO60318 1980 aa25.07■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 A0A0C4DFX4 3053 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 TSPY3P0CV98 308 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 TSPY8P0CW00 308 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 ITGB8P26012 769 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 ACLYP53396 1101 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 OAZ1P54368 228 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 PDE4BQ07343 736 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 SLFN13Q68D06 897 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 NAPBQ9H115 298 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 FBXO40Q9UH90 709 aa25.06■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.05■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 CHST13Q8NET6 341 aa25.05■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 FGD4Q96M96 766 aa25.05■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 STARD7Q9NQZ5 370 aa25.05■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.05■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 UNC80Q8N2C7 3258 aa25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 MOXD2PA6NHM9 499 aa25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 KIAA0355O15063 1070 aa25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 BMP3P12645 472 aa25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 PPARAQ07869 468 aa25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.04■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 MYADML2A6NDP7 307 aa25.03■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 RAG1P15918 1043 aa25.03■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 TFAP4Q01664 338 aa25.03■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 ACVR2BQ13705 512 aa25.03■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 KCNA10Q16322 511 aa25.02■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.02■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 TOX2Q96NM4 488 aa25.02■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa25.02■■□□□ 1.6
STX4-216ENST00000566353 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms