RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX11Q96FC9 970 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.72■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYH7P12883 1935 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAAP100Q0VG06 881 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 TOX2Q96NM4 488 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 COG6Q9Y2V7 657 aa20.71■□□□□ 0.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC4A3P48751 1232 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDH23Q9H251 3354 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 EYSQ5T1H1 3165 aa20.7■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNA10Q16322 511 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIPK3Q9Y572 518 aa20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 F5H6K3 240 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 NDUFB10O96000 172 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 RASA1P20936 1047 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNAJB2P25686 324 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLRC3Q07444 240 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 CPXCR1Q8N123 301 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 NYAP2Q9P242 653 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 VCANP13611 3396 aa20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBED4O75132 1171 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 TIMP1P01033 207 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRIN2CQ14957 1233 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 SBK1Q52WX2 424 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.67■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYADML2A6NDP7 307 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 ACVR2BQ13705 512 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIFC2Q96AC6 838 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPC25Q9HBM1 224 aa20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 ELP1O95163 1332 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATP2A1O14983 1001 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 TIFAQ96CG3 184 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBX21Q9UL17 535 aa20.65■□□□□ 0.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 ASGR1P07306 291 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 MFSD5Q6N075 450 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC174Q6PII3 467 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF576Q9H609 170 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 FBXO40Q9UH90 709 aa20.64■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 FEM1BQ9UK73 627 aa20.63■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADCY6O43306 1168 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDK7P50613 346 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNASQ5JWF2 1037 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARMCX2Q7L311 632 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM199Q8N511 208 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHST13Q8NET6 341 aa20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms