RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560589.5

TLE3-222, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TLE3, Length 3,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-222	ENST00000560589	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	TJP1	Q07157	1748 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	CTAGE9	A4FU28	777 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	CYP21A2	P08686	494 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	MAST3	O60307	1309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	LRRD1	A4D1F6	860 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	RPS6KA4	O75676	772 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	GYG1	P46976	350 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	CHRND	Q07001	517 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	ACCSL	Q4AC99	568 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	DIAPH2	O60879	1101 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	TUBB4A	P04350	444 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	MAF1	Q9H063	256 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	NUP98	P52948	1817 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC96	Q2M329	555 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	TCHH	Q07283	1943 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	SLC5A1	P13866	664 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	VPS37D	Q86XT2	251 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	TTC14	Q96N46	770 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	RGL1	Q9NZL6	768 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
TLE3-222	ENST00000560589	PPFIA1	Q13136	1202 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CUL3	Q13618	768 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	ME3	Q16798	604 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	MED23	Q9ULK4	1368 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	RAB27A	P51159	221 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	SEC24C	P53992	1094 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	TRIM58	Q8NG06	486 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	LPIN2	Q92539	896 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	NARF	Q9UHQ1	456 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CREB3	O43889	395 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	FANCC	Q00597	558 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	GRIK3	Q13003	919 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC93	Q567U6	631 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	NLRP3	Q96P20	1036 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	INCENP	Q9NQS7	918 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	FANCL	Q9NW38	375 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	OPLAH	O14841	1288 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	PSMA5	P28066	241 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	RASGRF1	Q13972	1273 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	TMEM110	Q86TL2	294 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	ABCC12	Q96J65	1359 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589		A0A1B0GVL5	298 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	HSF2BP	O75031	334 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	CCDC175	P0C221	793 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	ATP1A3	P13637	1013 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	OLFM4	Q6UX06	510 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TLE3-222	ENST00000560589	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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