RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 OSMRQ99650 979 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ADAM19Q9H013 955 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PIM2Q9P1W9 311 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 AK9Q5TCS8 1911 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 F6X3S4 739 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 H3BRJ5 948 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 LINC01387J3KSC0 135 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TM4SF5O14894 197 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TRPA1O75762 1119 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 FURINP09958 794 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF853P0CG23 659 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 PRELPP51888 382 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 DOC2BQ14184 412 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CITED4Q96RK1 184 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 STK31Q9BXU1 1019 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 SOX13Q9UN79 622 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD3-204ENST00000558666 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 PDE6BP35913 854 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 TGFB2P61812 414 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ORC1Q13415 861 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 TTLL6Q8N841 843 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 FAM89AQ96GI7 184 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC4O15439 1325 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 OTOFQ9HC10 1997 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 MYH7P12883 1935 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 F8W735 103 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 FSCN2O14926 492 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 GRIN3BO60391 1043 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 WISP1O95388 367 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 SRGNP10124 158 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NOS3P29474 1203 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 CDC25BP30305 580 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZS46 218 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NLRP10Q86W26 655 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 WNT8BQ93098 351 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NXPE3Q969Y0 559 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NYXQ9GZU5 481 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 HYPKQ9NX55 129 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF541Q9H0D2 1346 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 MYH8P13535 1937 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 PI4KAP2A4QPH2 592 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ERVV-1B6SEH8 477 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 ADAM11O75078 769 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NEFLP07196 543 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD3-204ENST00000558666 NPR1P16066 1061 aa5.44□□□□□ -1.54
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